Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D3Q587I9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms