Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FXNQ16595 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms