Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYCP1Q15431 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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