Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.499e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.574e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.13■■□□□ 1.932e-11■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.645e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 FGA-202ENST00000403106 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.895e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.285e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.987e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.857e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 319.09■□□□□ 0.651e-21■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-21■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BAG3-202ENST00000450186 1146 ntTSL 519.03■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-14■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-14■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.165e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.655e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.59□□□□□ -0.715e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.59□□□□□ -0.715e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.34□□□□□ -0.915e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.975e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.98□□□□□ -0.975e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.98□□□□□ -0.975e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 38□□□□□ -1.135e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.145e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.49□□□□□ -1.215e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.8□□□□□ -1.325e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.355e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.2□□□□□ -1.425e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.14□□□□□ -1.435e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 25.53□□□□□ -1.525e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.22□□□□□ -1.575e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.645e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.715e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 24.27□□□□□ -1.735e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.93□□□□□ -1.785e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.795e-13■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.584e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.34e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.194e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.154e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.134e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.674e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.554e-8■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 329.19■■■□□ 2.264e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 525.02■■□□□ 1.64e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.354e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 323.14■■□□□ 1.294e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 522.25■■□□□ 1.152e-16■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.074e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 TMBIM1-221ENST00000476429 462 ntTSL 320.63■□□□□ 0.894e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 519.41■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 MMD-202ENST00000571578 670 ntTSL 319.35■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CDK18-215ENST00000506215 435 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.64e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-16■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HGS-210ENST00000573320 547 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-16■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 316.46■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 416.42■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 DNAJC4-205ENST00000536006 693 ntTSL 316.15■□□□□ 0.182e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.116e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GTF3C1-205ENST00000564747 2798 nt15.7■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 215.35■□□□□ 0.054e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.036e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 HGS-211ENST00000573949 461 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-16■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 RPL28-202ENST00000426763 5620 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GTF3C1-203ENST00000562609 2824 ntTSL 513.9□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SMARCA4-216ENST00000591545 5193 ntTSL 213.72□□□□□ -0.211e-22■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-205ENST00000437761 758 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.296e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PSMF1-208ENST00000478004 632 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-214ENST00000534312 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.526e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 PSMF1-205ENST00000381899 704 ntTSL 211.6□□□□□ -0.554e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-207ENST00000525763 789 ntTSL 311.37□□□□□ -0.596e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.666e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.686e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-204ENST00000426650 741 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.726e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GSN-214ENST00000485767 6454 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.774e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-209ENST00000527926 633 ntTSL 39.96□□□□□ -0.826e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -16e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 TMBIM1-222ENST00000492966 400 ntTSL 47.93□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 12.9
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