Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCAPHQ15003 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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NCAPHQ15003 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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