Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2H3Q13889 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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