Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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