Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRQ13535 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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