Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPS1Q13098 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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