Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms