Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms