Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDO2P48775 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDO2P48775 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms