Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITPNBP48739 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms