Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms