Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms