Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms