Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPA1P15085 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA1P15085 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms