Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF2P04141 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms