Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E9PBE3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E9PBE3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E9PBE3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E9PBE3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E9PBE3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms