Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRRM5B3KS81 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms