Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
V9GYY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
V9GYY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
V9GYY5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
V9GYY5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
V9GYY5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
V9GYY5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
V9GYY5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
V9GYY5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
V9GYY5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
V9GYY5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
V9GYY5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
V9GYY5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
V9GYY5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
V9GYY5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
V9GYY5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
V9GYY5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
V9GYY5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
V9GYY5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
V9GYY5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
V9GYY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
V9GYY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
V9GYY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
V9GYY5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
V9GYY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
V9GYY5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
V9GYY5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
V9GYY5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
V9GYY5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
V9GYY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
V9GYY5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
V9GYY5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
V9GYY5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
V9GYY5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
V9GYY5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
V9GYY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
V9GYY5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
V9GYY5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
V9GYY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
V9GYY5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
V9GYY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
V9GYY5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
V9GYY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
V9GYY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
V9GYY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
V9GYY5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
V9GYY5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
V9GYY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
V9GYY5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
V9GYY5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
V9GYY5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GYY5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GYY5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GYY5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GYY5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GYY5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GYY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GYY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GYY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GYY5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GYY5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GYY5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GYY5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GYY5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms