Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPG1Q9Y678 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG1Q9Y678 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG1Q9Y678 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms