Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN6Q9UQ52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN6Q9UQ52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNTN6Q9UQ52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN6Q9UQ52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN6Q9UQ52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms