Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDZRN3Q9UPQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDZRN3Q9UPQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PDZRN3Q9UPQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDZRN3Q9UPQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms