Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LHX6Q9UPM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX6Q9UPM6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX6Q9UPM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms