Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A1LQ9UNN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1LQ9UNN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1LQ9UNN4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms