Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX7Q9UNH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX7Q9UNH6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX7Q9UNH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX7Q9UNH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms