Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHTF1Q9UMS5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHTF1Q9UMS5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms