Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX20Q9UHI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX20Q9UHI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX20Q9UHI6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms