Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L2Q9UHA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L2Q9UHA2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms