Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNN3Q9UGI6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN3Q9UGI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN3Q9UGI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNN3Q9UGI6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms