Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSRB1Q9NZV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSRB1Q9NZV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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