Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TVP23BQ9NYZ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TVP23BQ9NYZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms