Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIN1Q9NXP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GIN1Q9NXP7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIN1Q9NXP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms