Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAK1IP1Q9NWT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAK1IP1Q9NWT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK1IP1Q9NWT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms