Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCAF13Q9NV06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF13Q9NV06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF13Q9NV06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms