Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RRP7BPQ9NSQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RRP7BPQ9NSQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
RRP7BPQ9NSQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RRP7BPQ9NSQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms