Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNTG1Q9NSN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNTG1Q9NSN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG1Q9NSN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms