Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD18Q9NS91 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD18Q9NS91 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD18Q9NS91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD18Q9NS91 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms