Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LTBP3Q9NS15 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LTBP3Q9NS15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTBP3Q9NS15 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
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