Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS4Q9NRS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS4Q9NRS4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS4Q9NRS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms