Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDLIM7Q9NR12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDLIM7Q9NR12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDLIM7Q9NR12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM7Q9NR12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms