Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-211ENST00000434655 648 ntTSL 59.72□□□□□ -0.853e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CLPB-214ENST00000544683 624 ntTSL 59.61□□□□□ -0.873e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 PHAX-204ENST00000513813 1003 ntTSL 29.41□□□□□ -0.93e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-250ENST00000615493 712 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 PHAX-203ENST00000511371 847 ntTSL 28.24□□□□□ -1.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.123e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-204ENST00000439758 766 ntTSL 47.95□□□□□ -1.143e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.143e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 RAD54B-205ENST00000518998 599 ntTSL 37.86□□□□□ -1.153e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.23e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.343e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CD3D-205ENST00000534687 483 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CD3D-203ENST00000526561 257 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.853e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 416.94■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 552.5
UTP3Q9NQZ2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.391e-14■■■■■ 549.9
UTP3Q9NQZ2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-14■■■■■ 549.9
UTP3Q9NQZ2 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.74□□□□□ -0.851e-14■■■■■ 549.9
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 549
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 549
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.661e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-201ENST00000299673 2033 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.021e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-206ENST00000537189 560 ntTSL 417.89■□□□□ 0.451e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-209ENST00000539923 481 ntTSL 416.82■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-212ENST00000544257 1589 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-210ENST00000541044 555 ntTSL 37.59□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 548.1
UTP3Q9NQZ2 UBE3B-211ENST00000539843 586 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-32■■■■■ 546.5
UTP3Q9NQZ2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 ORC5-202ENST00000422497 2043 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-205ENST00000472068 850 ntTSL 516.26■□□□□ 0.196e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-206ENST00000483302 1994 ntTSL 215.84■□□□□ 0.136e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.046e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-209ENST00000498513 868 ntTSL 514.4□□□□□ -0.16e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.226e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.246e-44■■■■■ 540.3
UTP3Q9NQZ2 SLC29A2-204ENST00000541567 2272 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.773e-19■■■■■ 539.6
UTP3Q9NQZ2 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.35■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.66■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 47.56□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 539.2
UTP3Q9NQZ2 PIGG-207ENST00000504187 1784 ntTSL 218.09■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 538.2
UTP3Q9NQZ2 ZFPM2-209ENST00000522296 3312 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-26■■■■■ 534.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-207ENST00000558763 1957 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 532.5
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-215ENST00000560424 775 ntTSL 39.82□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 532.5
UTP3Q9NQZ2 POLK-216ENST00000514296 1536 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 POLK-206ENST00000505774 565 ntTSL 49.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 POLK-203ENST00000503479 2482 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 POLK-208ENST00000506928 3820 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 POLK-213ENST00000510815 2677 ntTSL 25.34□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 532.1
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-206ENST00000475022 1519 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.749e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.369e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.089e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 NCKIPSD-203ENST00000415281 803 ntTSL 313.17□□□□□ -0.39e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 EML3-214ENST00000524518 514 ntTSL 310.92□□□□□ -0.669e-29■■■■■ 531
UTP3Q9NQZ2 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 521.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 529.1
UTP3Q9NQZ2 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 219.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 529.1
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 528.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 528.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-203ENST00000481014 6505 ntTSL 29□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 528.9
UTP3Q9NQZ2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 527.9
UTP3Q9NQZ2 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 527.9
UTP3Q9NQZ2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 523.3
UTP3Q9NQZ2 GNAQ-202ENST00000411677 551 ntTSL 310.55□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 523.3
UTP3Q9NQZ2 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 521.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL8-206ENST00000506274 1924 ntTSL 229.09■■■□□ 2.251e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.021e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 21e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.331e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.331e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-205ENST00000573842 495 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-209ENST00000576921 1199 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.21e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.21e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.21e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-208ENST00000575214 1365 ntTSL 222.14■■□□□ 1.141e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.041e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PIPOX-208ENST00000580241 1772 ntTSL 521.54■■□□□ 1.041e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PIPOX-209ENST00000580383 580 ntTSL 320.94■□□□□ 0.941e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-204ENST00000573095 828 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 C1orf167-201ENST00000312793 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.38■□□□□ 0.851e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PIPOX-210ENST00000583215 1829 ntTSL 519.99■□□□□ 0.791e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-215ENST00000556160 841 ntTSL 518.99■□□□□ 0.631e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-21■■■■■ 521.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4363.5 ms