Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN3Q9NQS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN3Q9NQS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN3Q9NQS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms