Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6AQ9NPB6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARD6AQ9NPB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PARD6AQ9NPB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARD6AQ9NPB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms