Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF1Q9HCE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF1Q9HCE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms