Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC4Q9HBW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC4Q9HBW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4Q9HBW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC4Q9HBW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms