Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1Q9HAT0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms