Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A3Q9H7F0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms