Protein–RNA interactions for Protein: Q9H598

SLC32A1, Vesicular inhibitory amino acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC32A1Q9H598 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC32A1Q9H598 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC32A1Q9H598 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC32A1Q9H598 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC32A1Q9H598 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC32A1Q9H598 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC32A1Q9H598 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms